Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DEUP1Q05D60 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DEUP1Q05D60 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms