Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKCDQ05655 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms