Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIN1Q05586 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIN1Q05586 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms