Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 SVL3YPL032C 2478 nt2.83□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 MLH1YMR167W 2310 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YLL032CYLL032C 2478 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 KAP123YER110C 3342 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SMY1YKL079W 1971 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 PAU2YEL049W 363 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YDR186CYDR186C 2634 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SNF5YBR289W 2718 nt2.82□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 FIR1YER032W 2631 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 PHO91YNR013C 2685 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SMD1YGR074W 441 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 TRX1YLR043C 312 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YOR333CYOR333C 417 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YBR184WYBR184W 1572 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 VPS13YLL040C 9435 nt2.81□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 COS111YBR203W 2775 nt2.8□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 RPL20AYMR242C 519 nt2.8□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 MSB1YOR188W 3414 nt2.8□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SUL1YBR294W 2580 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SEF1YBL066C 3447 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 RIC1YLR039C 3171 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 SDC25YLL016W 3147 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 LCD1YDR499W 2244 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 NOP10YHR072W-A 177 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 UPS1YLR193C 528 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 CSE2YNR010W 450 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 TAE2YPL009C 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 BUB1YGR188C 3066 nt2.79□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 ESC1YMR219W 4977 nt2.78□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 MET6YER091C 2304 nt2.78□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YLR255CYLR255C 354 nt2.78□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.78□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 CFT2YLR115W 2580 nt2.78□□□□□ -1.96
HRQ1Q05549 VPS16YPL045W 2397 nt2.78□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 RGA2YDR379W 3030 nt2.77□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YOR302WYOR302W 78 nt2.77□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 INO80YGL150C 4470 nt2.77□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 PEP3YLR148W 2757 nt2.76□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.76□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YNL338WYNL338W 159 nt2.76□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 SSN2YDR443C 4263 nt2.76□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 VPS34YLR240W 2628 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YDR209CYDR209C 414 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YEL014CYEL014C 306 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 VPS55YJR044C 423 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YLR149CYLR149C 2193 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 DNA2YHR164C 4569 nt2.75□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 CRM1YGR218W 3255 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 GRR1YJR090C 3456 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 JSN1YJR091C 3276 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 AFI1YOR129C 2682 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 snR70snR70 164 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 ATP8Q0080 147 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YPR203WYPR203W 309 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 MMS22YLR320W 4365 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 VIK1YPL253C 1944 nt2.74□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 INP53YOR109W 3324 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 ACB1YGR037C 264 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YMR321CYMR321C 318 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 KTI11YBL071W-A 249 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 YBR277CYBR277C 402 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 RRP6YOR001W 2202 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 NOP53YPL146C 1368 nt2.73□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 CDC27YBL084C 2277 nt2.72□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 SMC6YLR383W 3345 nt2.72□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 SPF1YEL031W 3648 nt2.72□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 BNR1YIL159W 4128 nt2.72□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 SCH9YHR205W 2475 nt2.71□□□□□ -1.97
HRQ1Q05549 MUK1YPL070W 1839 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 EMC6YLL014W 327 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YEF3YLR249W 3135 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 MNL2YLR057W 2550 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SWI6YLR182W 2412 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 PLC1YPL268W 2610 nt2.71□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SSQ1YLR369W 1974 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SSS1YDR086C 243 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 OLI1Q0130 231 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 INP2YMR163C 2118 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 HSC82YMR186W 2118 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 PDE2YOR360C 1581 nt2.7□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 MDM20YOL076W 2391 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 PXA2YKL188C 2562 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 NEW1YPL226W 3591 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 FKS3YMR306W 5358 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 MMS1YPR164W 4224 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SNC1YAL030W 354 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 RRT15YLR162W-A 189 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 snR43snR43 209 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YBT1YLL048C 4986 nt2.69□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 SPT21YMR179W 2277 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YDR286CYDR286C 345 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YNL114CYNL114C 372 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YOR015WYOR015W 360 nt2.68□□□□□ -1.98
HRQ1Q05549 YOR170WYOR170W 306 nt2.68□□□□□ -1.98
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