Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBXN1Q04323 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBXN1Q04323 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms