Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CACNB1Q02641 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms