Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CENPEQ02224 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CENPEQ02224 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms