Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms