Protein–RNA interactions for Protein: Q02209

YKR011C, Uncharacterized protein YKR011C, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR011CQ02209 YEL043WYEL043W 2871 nt2.55□□□□□ -2
YKR011CQ02209 RPL42BYHR141C 321 nt2.55□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.55□□□□□ -2
YKR011CQ02209 RPL42AYNL162W 321 nt2.55□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YIL080WYIL080W 4722 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 INP2YMR163C 2118 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 SWR1YDR334W 4545 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 GIS1YDR096W 2685 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YBL083CYBL083C 426 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 SWI6YLR182W 2412 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 AMS1YGL156W 3252 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 MUK1YPL070W 1839 nt2.54□□□□□ -2
YKR011CQ02209 CDC53YDL132W 2448 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YER138CYER138C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YER160CYER160C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YJR027WYJR027W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YML039WYML039W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YML045WYML045W 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YMR050CYMR050C 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YIL174WYIL174W 228 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 CAF120YNL278W 3183 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 CYR1YJL005W 6081 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 RPH1YER169W 2391 nt2.53□□□□□ -2
YKR011CQ02209 FLO11YIR019C 4104 nt2.53□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 INA22YIR024C 651 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 VPS55YJR044C 423 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 snR43snR43 209 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 VMR1YHL035C 4779 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 PDE2YOR360C 1581 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 UTP14YML093W 2700 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SPT21YMR179W 2277 nt2.52□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 MGM1YOR211C 2646 nt2.51□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YDR286CYDR286C 345 nt2.51□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 RPS22AYJL190C 393 nt2.51□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 MMS22YLR320W 4365 nt2.51□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 IRR1YIL026C 3453 nt2.51□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SET2YJL168C 2202 nt2.5□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SMY2YBR172C 2223 nt2.5□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YJL135WYJL135W 318 nt2.5□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YNL338WYNL338W 159 nt2.5□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YKU80YMR106C 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 AXL1YPR122W 3627 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YEL014CYEL014C 306 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 GEA1YJR031C 4227 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SLM1YIL105C 2061 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 BNR1YIL159W 4128 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SAP1YER047C 2694 nt2.49□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 ZRG8YER033C 3231 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YNL018CYNL018C 1839 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 OLI1Q0130 231 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 RRT15YLR162W-A 189 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 RPB10YOR210W 213 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 SWI5YDR146C 2130 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 RFX1YLR176C 2436 nt2.48□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YPL216WYPL216W 3309 nt2.47□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 NUM1YDR150W 8247 nt2.47□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 YJL150WYJL150W 303 nt2.47□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 VPS54YDR027C 2670 nt2.47□□□□□ -2.01
YKR011CQ02209 PTP3YER075C 2787 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 DBP10YDL031W 2988 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 COX14YML129C 213 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 MRD1YPR112C 2664 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 SLY1YDR189W 2001 nt2.46□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YCR043CYCR043C 384 nt2.45□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 snR72snR72 98 nt2.45□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.45□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YPR092WYPR092W 306 nt2.45□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 BCK1YJL095W 4437 nt2.45□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 ATP8Q0080 147 nt2.44□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 YPL150WYPL150W 2706 nt2.44□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 TRS65YGR166W 1683 nt2.44□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 VTC3YPL019C 2508 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 TRA1YHR099W 11235 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 EMP24YGL200C 612 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 COA4YLR218C 453 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 TOR1YJR066W 7413 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 LYS14YDR034C 2373 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 MPT5YGL178W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 SRO77YBL106C 3033 nt2.42□□□□□ -2.02
YKR011CQ02209 PAU8YAL068C 363 nt2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms