Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FANCCQ00597 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FANCCQ00597 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms