Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC42EP1Q00587 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP1Q00587 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms