Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CDK5Q00535 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDK5Q00535 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms