Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SKOR1P84550 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SKOR1P84550 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms