Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RELNP78509 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RELNP78509 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RELNP78509 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RELNP78509 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RELNP78509 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RELNP78509 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELNP78509 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELNP78509 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELNP78509 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELNP78509 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RELNP78509 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms