Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNA1P78396 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNA1P78396 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms