Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PITX1P78337 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PITX1P78337 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PITX1P78337 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITX1P78337 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PITX1P78337 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PITX1P78337 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms