Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPFP62306 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPFP62306 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms