Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
RPS29P62273 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RPS29P62273 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RPS29P62273 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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