Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UFM1P61960 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UFM1P61960 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UFM1P61960 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms