Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms