Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GSDMDP57764 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms