Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBASH3AP57075 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBASH3AP57075 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms