Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
H2BFSP57053 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
H2BFSP57053 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms