Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NME5P56597 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NME5P56597 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME5P56597 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME5P56597 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME5P56597 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NME5P56597 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NME5P56597 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NME5P56597 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NME5P56597 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms