Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNU13P55769 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNU13P55769 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNU13P55769 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms