Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MANFP55145 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MANFP55145 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MANFP55145 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MANFP55145 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MANFP55145 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MANFP55145 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MANFP55145 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MANFP55145 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms