Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AQP4P55087 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AQP4P55087 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AQP4P55087 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AQP4P55087 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AQP4P55087 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AQP4P55087 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AQP4P55087 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AQP4P55087 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AQP4P55087 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms