Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms