Protein–RNA interactions for Protein: P53830

CUS2, Cold sensitive U2 snRNA suppressor 2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUS2P53830 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.99□□□□□ -2.25
CUS2P53830 RCN1YKL159C 636 nt0.99□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YPL197CYPL197C 414 nt0.99□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YCL046WYCL046W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YCL020WYCL020W 1317 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 RTR1YER139C 681 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 TIM10YHR005C-A 282 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 RPL42BYHR141C 321 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YKL111CYKL111C 336 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 SWS2YNL081C 432 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 RPL42AYNL162W 321 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 SGO1YOR073W 1773 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.98□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YGR130CYGR130C 2451 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 CDC39YCR093W 6327 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 PRP21YJL203W 843 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 SWI4YER111C 3282 nt0.97□□□□□ -2.25
CUS2P53830 UTP13YLR222C 2454 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 VPS54YDR027C 2670 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 CHZ1YER030W 462 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YML003WYML003W 873 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 RPL9BYNL067W 576 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 EAF1YDR359C 2949 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 DCP2YNL118C 2913 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 TTI1YKL033W 3117 nt0.96□□□□□ -2.26
CUS2P53830 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YFL012WYFL012W 447 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 PRM8YGL053W 714 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YJR079WYJR079W 330 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 HCH1YNL281W 462 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.95□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YEL057CYEL057C 702 nt0.94□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YOL029CYOL029C 606 nt0.94□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YPR147CYPR147C 915 nt0.94□□□□□ -2.26
CUS2P53830 SRP14YDL092W 441 nt0.93□□□□□ -2.26
CUS2P53830 SPO13YHR014W 876 nt0.93□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YLR252WYLR252W 306 nt0.93□□□□□ -2.26
CUS2P53830 DDR48YMR173W 1293 nt0.93□□□□□ -2.26
CUS2P53830 KAP120YPL125W 3099 nt0.93□□□□□ -2.26
CUS2P53830 PAU18YLL064C 363 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 NBP1YLR457C 960 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 PAU6YNR076W 363 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 ERP4YOR016C 624 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 ZRG17YNR039C 1818 nt0.92□□□□□ -2.26
CUS2P53830 PAU2YEL049W 363 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 YNL114CYNL114C 372 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 IRC16YPR038W 360 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 APL3YBL037W 3078 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 SPT21YMR179W 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 NUT1YGL151W 3399 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 GDS1YOR355W 1569 nt0.91□□□□□ -2.26
CUS2P53830 NUP145YGL092W 3954 nt0.9□□□□□ -2.26
CUS2P53830 PIP2YOR363C 2991 nt0.9□□□□□ -2.26
CUS2P53830 MSS11YMR164C 2277 nt0.9□□□□□ -2.26
CUS2P53830 QCR7YDR529C 384 nt0.9□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YER121WYER121W 345 nt0.9□□□□□ -2.27
CUS2P53830 VMA21YGR105W 234 nt0.9□□□□□ -2.27
CUS2P53830 AFB1YLR040C 675 nt0.9□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YDL016CYDL016C 303 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 HNT1YDL125C 477 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SMB1YER029C 591 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YIL029CYIL029C 429 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 GMC2YLR445W 567 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 UBX4YMR067C 1251 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 snR14snR14 160 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 BUD3YCL014W 4911 nt0.89□□□□□ -2.27
CUS2P53830 HDA3YPR179C 1968 nt0.88□□□□□ -2.27
CUS2P53830 CDC24YAL041W 2565 nt0.88□□□□□ -2.27
CUS2P53830 PAU24YBR301W 363 nt0.88□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
CUS2P53830 IFH1YLR223C 3258 nt0.88□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SNU56YDR240C 1479 nt0.87□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YDR029WYDR029W 315 nt0.87□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.87□□□□□ -2.27
CUS2P53830 RPS18BYML026C 441 nt0.87□□□□□ -2.27
CUS2P53830 PPN1YDR452W 2025 nt0.87□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SMC1YFL008W 3678 nt0.86□□□□□ -2.27
CUS2P53830 IRC23YOR044W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
CUS2P53830 ZIP1YDR285W 2628 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SWI5YDR146C 2130 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 snR84snR84 550 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 RTT102YGR275W 474 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YJR141WYJR141W 1044 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SAS3YBL052C 2496 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 NOC3YLR002C 1992 nt0.85□□□□□ -2.27
CUS2P53830 SHE9YDR393W 1371 nt0.84□□□□□ -2.27
CUS2P53830 YDL152WYDL152W 366 nt0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms