Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 FLO5YHR211W 3228 nt2.95□□□□□ -1.94
SOK2P53438 PRP6YBR055C 2700 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 SIR3YLR442C 2937 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 HYP2YEL034W 474 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RPL23BYER117W 414 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YNL114CYNL114C 372 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 ACM1YPL267W 630 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 KAP104YBR017C 2757 nt2.94□□□□□ -1.94
SOK2P53438 SLY1YDR189W 2001 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RFX1YLR176C 2436 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 SNF5YBR289W 2718 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 MMS22YLR320W 4365 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 IRR1YIL026C 3453 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RRM3YHR031C 2172 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RPL6AYML073C 531 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YOR102WYOR102W 351 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 MET5YJR137C 4329 nt2.93□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RIC1YLR039C 3171 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 CHS2YBR038W 2892 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YDR341CYDR341C 1824 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 PMP2YEL017C-A 132 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 SBH1YER087C-B 249 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 RPS28BYLR264W 204 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YBL012CYBL012C 402 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 NCA2YPR155C 1851 nt2.92□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.91□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YDL242WYDL242W 354 nt2.91□□□□□ -1.94
SOK2P53438 YFR016CYFR016C 3702 nt2.9□□□□□ -1.94
SOK2P53438 SUL1YBR294W 2580 nt2.9□□□□□ -1.94
SOK2P53438 DYN2YDR424C 279 nt2.9□□□□□ -1.95
SOK2P53438 ATG13YPR185W 2217 nt2.9□□□□□ -1.95
SOK2P53438 ENA5YDR038C 3276 nt2.9□□□□□ -1.95
SOK2P53438 KAP123YER110C 3342 nt2.9□□□□□ -1.95
SOK2P53438 PTP3YER075C 2787 nt2.89□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YDL196WYDL196W 330 nt2.89□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RPL20AYMR242C 519 nt2.89□□□□□ -1.95
SOK2P53438 DSE4YNR067C 3354 nt2.89□□□□□ -1.95
SOK2P53438 MSC6YOR354C 2079 nt2.89□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YLR278CYLR278C 4026 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 snR61snR61 90 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RPL42BYHR141C 321 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RPL42AYNL162W 321 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 SCH9YHR205W 2475 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 SNQ2YDR011W 4506 nt2.88□□□□□ -1.95
SOK2P53438 PSK1YAL017W 4071 nt2.87□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RGA2YDR379W 3030 nt2.87□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YJL120WYJL120W 324 nt2.87□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YIL080WYIL080W 4722 nt2.87□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RRP12YPL012W 3687 nt2.86□□□□□ -1.95
SOK2P53438 SRP14YDL092W 441 nt2.86□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.86□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.86□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RPS25BYLR333C 327 nt2.86□□□□□ -1.95
SOK2P53438 ATG11YPR049C 3537 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YBR099CYBR099C 384 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YKU80YMR106C 1890 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 REC8YPR007C 2043 nt2.85□□□□□ -1.95
SOK2P53438 TAE2YPL009C 3117 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 STB4YMR019W 2850 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 RGR1YLR071C 3249 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 TSC11YER093C 4293 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 SPO22YIL073C 2928 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 FUN30YAL019W 3396 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YCR043CYCR043C 384 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 BUD4YJR092W 4344 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 INP52YNL106C 3552 nt2.84□□□□□ -1.95
SOK2P53438 CRM1YGR218W 3255 nt2.84□□□□□ -1.96
SOK2P53438 VAS1YGR094W 3315 nt2.84□□□□□ -1.96
SOK2P53438 LYS14YDR034C 2373 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 MNE1YOR350C 1992 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 RCY1YJL204C 2523 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 RTT10YPL183C 3042 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 FIG4YNL325C 2640 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 GIS1YDR096W 2685 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YOR296WYOR296W 3870 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 RPA135YPR010C 3612 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 MNL2YLR057W 2550 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 POL3YDL102W 3294 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 SWI5YDR146C 2130 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 ROM1YGR070W 3468 nt2.83□□□□□ -1.96
SOK2P53438 UBP14YBR058C 2346 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 NET1YJL076W 3570 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 PUT3YKL015W 2940 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 AFI1YOR129C 2682 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 ZRG17YNR039C 1818 nt2.82□□□□□ -1.96
SOK2P53438 EMP24YGL200C 612 nt2.81□□□□□ -1.96
SOK2P53438 APL5YPL195W 2799 nt2.81□□□□□ -1.96
SOK2P53438 ZRG8YER033C 3231 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 147.3 ms