Protein–RNA interactions for Protein: P53010

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 1,115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAN2P53010 TMN3YER113C 2121 nt2.52□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.52□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.52□□□□□ -2.01
PAN2P53010 CYB5YNL111C 363 nt2.52□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YGR250CYGR250C 2346 nt2.52□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SMD1YGR074W 441 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YGR151CYGR151C 336 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 NUT2YPR168W 474 nt2.51□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SVL3YPL032C 2478 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 AMS1YGL156W 3252 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SCW11YGL028C 1629 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 NPR2YEL062W 1848 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 FMP16YDR070C 282 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 GPG1YGL121C 381 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 PFD1YJL179W 330 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YOL160WYOL160W 342 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.5□□□□□ -2.01
PAN2P53010 PEX8YGR077C 1770 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 STE11YLR362W 2154 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YBR224WYBR224W 516 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SLN1YIL147C 3663 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 TRA1YHR099W 11235 nt2.49□□□□□ -2.01
PAN2P53010 MVP1YMR004W 1536 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SWA2YDR320C 2007 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YDR426CYDR426C 378 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 NOP10YHR072W-A 177 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 CSF1YLR087C 8877 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 NUM1YDR150W 8247 nt2.48□□□□□ -2.01
PAN2P53010 PHO2YDL106C 1680 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 SDC25YLL016W 3147 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 PAU2YEL049W 363 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 UPS1YLR193C 528 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YNL028WYNL028W 318 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 YOR333CYOR333C 417 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 snR43snR43 209 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 VPS13YLL040C 9435 nt2.47□□□□□ -2.01
PAN2P53010 PSD2YGR170W 3417 nt2.46□□□□□ -2.01
PAN2P53010 VPH1YOR270C 2523 nt2.46□□□□□ -2.01
PAN2P53010 EFR3YMR212C 2349 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 RGA2YDR379W 3030 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YLR255CYLR255C 354 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 CRS5YOR031W 210 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YOR302WYOR302W 78 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 NEW1YPL226W 3591 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 SEF1YBL066C 3447 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 TAE2YPL009C 3117 nt2.46□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YEF3YLR249W 3135 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 KAP123YER110C 3342 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 TRX1YLR043C 312 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 PHO91YNR013C 2685 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 VPS16YPL045W 2397 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 SMY1YKL079W 1971 nt2.45□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YGL052WYGL052W 306 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YGR050CYGR050C 357 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 CSE2YNR010W 450 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YDR186CYDR186C 2634 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 SNF5YBR289W 2718 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 SPF1YEL031W 3648 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YBR184WYBR184W 1572 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 LCD1YDR499W 2244 nt2.44□□□□□ -2.02
PAN2P53010 RIC1YLR039C 3171 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 CFT2YLR115W 2580 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 MSB1YOR188W 3414 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 NOP53YPL146C 1368 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 SWR1YDR334W 4545 nt2.43□□□□□ -2.02
PAN2P53010 VPS34YLR240W 2628 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 PEP3YLR148W 2757 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YLR149CYLR149C 2193 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YRB1YDR002W 606 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 ACB1YGR037C 264 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 EMC6YLL014W 327 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YBR277CYBR277C 402 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YNL018CYNL018C 1839 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 COS111YBR203W 2775 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 MDM20YOL076W 2391 nt2.42□□□□□ -2.02
PAN2P53010 GRR1YJR090C 3456 nt2.41□□□□□ -2.02
PAN2P53010 MRP10YDL045W-A 288 nt2.41□□□□□ -2.02
PAN2P53010 AFI1YOR129C 2682 nt2.41□□□□□ -2.02
PAN2P53010 NUP170YBL079W 4509 nt2.41□□□□□ -2.02
PAN2P53010 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.4□□□□□ -2.03
PAN2P53010 YMR321CYMR321C 318 nt2.4□□□□□ -2.03
PAN2P53010 CDC27YBL084C 2277 nt2.4□□□□□ -2.03
PAN2P53010 EDS1YBR033W 2760 nt2.4□□□□□ -2.03
PAN2P53010 CRM1YGR218W 3255 nt2.4□□□□□ -2.03
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