Protein–RNA interactions for Protein: P51861

CDR1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR1P51861 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR1P51861 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR1P51861 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR1P51861 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR1P51861 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDR1P51861 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDR1P51861 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDR1P51861 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDR1P51861 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDR1P51861 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms