Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRIM1P49642 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRIM1P49642 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms