Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPFP49454 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CENPFP49454 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPFP49454 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPFP49454 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms