Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNI2P48788 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNI2P48788 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms