Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms