Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NR4A2P43354 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms