Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRATP43155 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CRATP43155 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CRATP43155 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CRATP43155 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CRATP43155 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CRATP43155 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms