Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTTP42858 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTTP42858 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTTP42858 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTTP42858 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTTP42858 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTTP42858 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTTP42858 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTTP42858 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HTTP42858 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTTP42858 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTTP42858 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTTP42858 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTTP42858 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTTP42858 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms