Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NCAPD3P42695 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms