Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YKL123WYKL123W 381 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 RPS18BYML026C 441 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 DDR48YMR173W 1293 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YOR376WYOR376W 369 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 UFD2YDL190C 2886 nt1.19□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.18□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YJR141WYJR141W 1044 nt1.18□□□□□ -2.22
DDI1P40087 RPL40BYKR094C 387 nt1.18□□□□□ -2.22
DDI1P40087 NOP15YNL110C 663 nt1.18□□□□□ -2.22
DDI1P40087 AZF1YOR113W 2745 nt1.18□□□□□ -2.22
DDI1P40087 HDA3YPR179C 1968 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 ZRG17YNR039C 1818 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YPR117WYPR117W 7470 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 RRT15YLR162W-A 189 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 CTK3YML112W 891 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YPR099CYPR099C 357 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 UBP3YER151C 2739 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 RSM22YKL155C 1887 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 SHE9YDR393W 1371 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 MSN5YDR335W 3675 nt1.17□□□□□ -2.22
DDI1P40087 UBX4YMR067C 1251 nt1.16□□□□□ -2.22
DDI1P40087 GAL7YBR018C 1101 nt1.16□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YOR248WYOR248W 303 nt1.16□□□□□ -2.22
DDI1P40087 SVS1YPL163C 783 nt1.16□□□□□ -2.22
DDI1P40087 SEC5YDR166C 2916 nt1.16□□□□□ -2.22
DDI1P40087 PAN3YKL025C 2040 nt1.15□□□□□ -2.22
DDI1P40087 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 RPL33BYOR234C 324 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 TIM18YOR297C 579 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YPR039WYPR039W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 RAD50YNL250W 3939 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YAR009CYAR009C 3591 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SWI5YDR146C 2130 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.15□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YDL211CYDL211C 1119 nt1.14□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SNU56YDR240C 1479 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 NUP188YML103C 4968 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YDR029WYDR029W 315 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YDR509WYDR509W 348 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YGL217CYGL217C 342 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YBR032WYBR032W 303 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SLX4YLR135W 2247 nt1.13□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YGR130CYGR130C 2451 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SPR3YGR059W 1539 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 PAU2YEL049W 363 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YPR063CYPR063C 423 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SPO75YLL005C 2607 nt1.12□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SGO1YOR073W 1773 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SRP14YDL092W 441 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 MET32YDR253C 576 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 ILM1YJR118C 612 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YOP1YPR028W 543 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 TTI1YKL033W 3117 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 NST1YNL091W 3723 nt1.11□□□□□ -2.23
DDI1P40087 APL1YJR005W 2103 nt1.1□□□□□ -2.23
DDI1P40087 RPL34BYIL052C 366 nt1.1□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YBR071WYBR071W 636 nt1.1□□□□□ -2.23
DDI1P40087 ZIP1YDR285W 2628 nt1.1□□□□□ -2.23
DDI1P40087 TOF2YKR010C 2316 nt1.1□□□□□ -2.23
DDI1P40087 SPT7YBR081C 3999 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 GDS1YOR355W 1569 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 VAM6YDL077C 3150 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 MDS3YGL197W 4464 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 YDR008CYDR008C 351 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.09□□□□□ -2.23
DDI1P40087 VPS54YDR027C 2670 nt1.09□□□□□ -2.24
DDI1P40087 MUK1YPL070W 1839 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YLL054CYLL054C 2532 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 snR84snR84 550 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 TMA22YJR014W 597 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 RPL9BYNL067W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.08□□□□□ -2.24
DDI1P40087 BUD3YCL014W 4911 nt1.07□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YML003WYML003W 873 nt1.07□□□□□ -2.24
DDI1P40087 RCN2YOR220W 798 nt1.07□□□□□ -2.24
DDI1P40087 HUR1YGL168W 333 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YAP3YHL009C 993 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YLL020CYLL020C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 snR13snR13 124 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 snR14snR14 160 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 MKT1YNL085W 2493 nt1.06□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YGR025WYGR025W 303 nt1.05□□□□□ -2.24
DDI1P40087 SPO23YBR250W 1572 nt1.04□□□□□ -2.24
DDI1P40087 YER135CYER135C 393 nt1.04□□□□□ -2.24
DDI1P40087 RTR1YER139C 681 nt1.04□□□□□ -2.24
DDI1P40087 SWI4YER111C 3282 nt1.04□□□□□ -2.24
DDI1P40087 NUT1YGL151W 3399 nt1.04□□□□□ -2.24
DDI1P40087 COG4YPR105C 2586 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 LYS14YDR034C 2373 nt1.03□□□□□ -2.24
DDI1P40087 RPL9AYGL147C 576 nt1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms