Protein–RNA interactions for Protein: P40005

GIM4, Prefoldin subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM4P40005 CHZ1YER030W 462 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM4P40005 LSO2YGR169C-A 279 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM4P40005 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM4P40005 NBP1YLR457C 960 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM4P40005 SLM6YBR266C 453 nt0.42□□□□□ -2.34
GIM4P40005 TRS65YGR166W 1683 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM4P40005 YOR199WYOR199W 330 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM4P40005 AI1Q0050 2505 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM4P40005 GEA2YEL022W 4380 nt0.41□□□□□ -2.34
GIM4P40005 NUT2YPR168W 474 nt0.4□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.4□□□□□ -2.35
GIM4P40005 THG1YGR024C 714 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM4P40005 RPL42BYHR141C 321 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM4P40005 RPL42AYNL162W 321 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YBR032WYBR032W 303 nt0.39□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YCL020WYCL020W 1317 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 RPL29YFR032C-A 180 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YGL204CYGL204C 306 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 ECM12YHR021W-A 456 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YIL059CYIL059C 366 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 UBX4YMR067C 1251 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 ISF1YMR081C 1017 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 LTE1YAL024C 4308 nt0.38□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YBR184WYBR184W 1572 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM4P40005 PAN2YGL094C 3348 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM4P40005 LYS14YDR034C 2373 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM4P40005 UBC7YMR022W 498 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM4P40005 NOC3YLR002C 1992 nt0.37□□□□□ -2.35
GIM4P40005 KAR3YPR141C 2190 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM4P40005 REF2YDR195W 1602 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM4P40005 NTF2YER009W 378 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM4P40005 RSM18YER050C 417 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YGL042CYGL042C 306 nt0.36□□□□□ -2.35
GIM4P40005 IES5YER092W 378 nt0.35□□□□□ -2.35
GIM4P40005 UFE1YOR075W 1041 nt0.35□□□□□ -2.35
GIM4P40005 NUP82YJL061W 2142 nt0.34□□□□□ -2.35
GIM4P40005 AIM44YPL158C 2277 nt0.34□□□□□ -2.35
GIM4P40005 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM4P40005 PSF2YJL072C 642 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ABF2YMR072W 552 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM4P40005 IES4YOR189W 351 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM4P40005 STO1YMR125W 2586 nt0.34□□□□□ -2.36
GIM4P40005 SRP14YDL092W 441 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YJL086CYJL086C 369 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM4P40005 RPS7BYNL096C 573 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YOR366WYOR366W 354 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM4P40005 PXA2YKL188C 2562 nt0.33□□□□□ -2.36
GIM4P40005 VPS74YDR372C 1038 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ALG13YGL047W 609 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM4P40005 SAG1YJR004C 1953 nt0.32□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM4P40005 snR44snR44 211 nt0.31□□□□□ -2.36
GIM4P40005 HDA3YPR179C 1968 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YDL068WYDL068W 330 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 OCA6YDR067C 675 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ATC1YDR184C 885 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YDR509WYDR509W 348 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YPR172WYPR172W 603 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 IQG1YPL242C 4488 nt0.3□□□□□ -2.36
GIM4P40005 TIM8YJR135W-A 264 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM4P40005 RUF22RUF22 515 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ZIP1YDR285W 2628 nt0.29□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ALY2YJL084C 3141 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 VPS63YLR261C 327 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 ATG16YMR159C 453 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YMR321CYMR321C 318 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 DBP6YNR038W 1890 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 MKT1YNL085W 2493 nt0.28□□□□□ -2.36
GIM4P40005 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.27□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SPC2YML055W 537 nt0.27□□□□□ -2.37
GIM4P40005 YOP1YPR028W 543 nt0.27□□□□□ -2.37
GIM4P40005 PDE2YOR360C 1581 nt0.27□□□□□ -2.37
GIM4P40005 GMC2YLR445W 567 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SPR2YOR214C 711 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SLD3YGL113W 2007 nt0.26□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SCW11YGL028C 1629 nt0.25□□□□□ -2.37
GIM4P40005 snR34snR34 203 nt0.25□□□□□ -2.37
GIM4P40005 BIR1YJR089W 2865 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM4P40005 RMD6YEL072W 696 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM4P40005 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM4P40005 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM4P40005 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.24□□□□□ -2.37
GIM4P40005 VPS52YDR484W 1926 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM4P40005 YGR290WYGR290W 444 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SUS1YBR111W-A 291 nt0.23□□□□□ -2.37
GIM4P40005 SWI5YDR146C 2130 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM4P40005 RUB1YDR139C 234 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM4P40005 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM4P40005 GIM5YML094W 492 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM4P40005 YPR170CYPR170C 336 nt0.22□□□□□ -2.37
GIM4P40005 GPX1YKL026C 504 nt0.21□□□□□ -2.38
GIM4P40005 KAR1YNL188W 1302 nt0.2□□□□□ -2.38
GIM4P40005 ISD11YER048W-A 285 nt0.2□□□□□ -2.38
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