Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TGFBR1P36897 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TGFBR1P36897 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms