Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPB2P35606 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPB2P35606 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB2P35606 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPB2P35606 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPB2P35606 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms