Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPC1P35052 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GPC1P35052 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GPC1P35052 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms