Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ABCC1P33527 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCC1P33527 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms