Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHRNA3P32297 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNA3P32297 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNA3P32297 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNA3P32297 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms