Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXA6P31267 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXA6P31267 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms