Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCND3P30281 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCND3P30281 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCND3P30281 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCND3P30281 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCND3P30281 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCND3P30281 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCND3P30281 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCND3P30281 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms