Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CRABP1P29762 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms